Три столетия прошло с момента "Опустошения", как назвали конфликт между Землей и колонизированным Марсом. На дворе 2563-ый год, а любые андроиды с искусственным интеллектом строжайше запрещены. Колыбель цивилизации лежит в руинах, а двумя оставшимися крупными городами стали благополучный Залем, летающий в облаках и Айрон-Сити, куда стекаются бедняки. Ученый по имени Дайсон Идо в свое время не смог спасти жизнь единственной дочери Алиты, хотя планировал перенести сознание девушки в